QuantiFish
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QuantiFish

Développement de méthodes ADNe quantitatives pour l’étude de la phénologie des poissons en lacs

SECTION

Surveillance innovante

PERIODE

Juillet 2021 - Décembre 2022
Illustration

FINANCEMENT

Pôle ECLA

ZONE(S) D'ÉTUDE

Lac Léman

PARTENAIRES

Université Savoie Mont Blanc, INRAE, CARRTEL, OLA 74200 Thonon-les-Bains, France

COORDINATEUR(S)

M. Vautier
I. Domaizon

Description du Projet

Contexte du Projet :

Le suivi de la phénologie de la reproduction des poissons en lacs est crucial pour évaluer l’état des peuplements, détecter les déclins et adapter les mesures de gestion. Les méthodes traditionnelles de suivi sont souvent contraignantes (chronophages, inefficaces sur de faible densité, voire létales). L’ADN environnemental offre une alternative non invasive, sensible et simple sur le terrain. Couplée à de récentes approches quantitatives ultra-sensibles comme la PCR digitale, elle pourrait permettre des estimations d’abondance fines capables de caractériser les périodes de reproduction des poissons en lacs.

Objectifs du Projet :

L'objectif principal du projet QuantiFish est de développer et d'évaluer l'efficacité d’approches ADNe couplées à la PCR digitale pour suivre la phénologie de la reproduction des peuplements piscicoles lacustres, en comparaison avec les méthodes traditionnelles (pêches aux filets, comptages visuels). Ces développements ont ciblé 4 espèces d’intérêt économique, écologique et patrimonial : le corégone, l’omble chevalier, le brochet et la perche. Les objectifs secondaires portent sur des optimisations techniques, comme le choix des cibles génomiques ou encore des méthodes d’échantillonnage et de filtration.

Résultat du Projet

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Pour aller plus loin

Liens Utiles :

https://doi.org/10.1016/j.fishres.2023.106708

Contact : marine.vautier@inrae.fr