Ecole d’été - Biomarqueurs pour la surveillance écologique des lacs

22–26 juin 2026, Thonon-les-Bains (France)

Les inscriptions sont fermées



Vous souhaitez améliorer vos connaissances en matière de surveillance écologique des lacs ?

Participez à la 5ème édition de l’école d’été « Biomarqueurs pour la surveillance écologique des lacs ».

Cette formation, proposée par l’UMR CARRTEL (INRAE-USMB), met l'accent sur les biomarqueurs et les méthodes à haute fréquence.
Les cours seront basés sur des échantillonnages terrain et des ateliers pratiques. Ils permettront de présenter différentes approches et techniques actuelles de pointe (p.ex. génétique, isotopie, acoustique, etc.) pour étudier le fonctionnement des écosystèmes lacustres soumis à plusieurs pressions anthropiques.

La formation est structurée autour de trois domaines d’applications principaux :
  • Diagnostic de l'état écologique des lacs :
    Mesures in situ des paramètres physico-chimiques, échantillonnage de certains indicateurs biologiques communs ;
  • Diagnostic de la diversité spécifique :
    Utilisation de l'ADN environnemental pour les suivis écologiques et la bioindication, l'hydroacoustique pour la surveillance non invasive des poissons, le ZooScan et reconnaissance automatisée des images pour les suivis des populations de zooplancton ;
  • Diagnostic du fonctionnement des écosystèmes, des interactions biotiques :
    Principes de l'utilisation des isotopes stables comme biomarqueurs du transfert trophique.

Pendant les activités de cette école d’été, les stagiaires pourront participer à la création d'une courte « vidéo capsule » sur un des sujets proposés pendant la formation. La « vidéo capsule » sera publiée en libre accès, par la suite, afin d’être utilisée par les enseignants et les étudiants à des fins éducatives.

Exemple de capsule

Les cours seront assurés par le personnel du CARRTEL et dispensés en anglais dans un groupe international.

Programme année précédente

Port de la station UMR CARRTEL
Démonstration de lecture de profil de température, Chl a-Crédits photos: S. RASCONI © S. RASCONI
Manipulation en laboratoire-Crédits photos: A. TESSIER © A. TESSIER
Séance de cours-Crédits photos: A. TESSIER © A. TESSIER


Informations utiles :

  Etudiant en master ou en doctorat
(Selon places restantes : jeune chercheur, ingénieur et technicien)

  5 jours

  Hébergement partagé - Centre de Thonon-les-Bains

  Formation et hébergement financés par le Pôle R&D ECLA et le CARRTEL. Les frais autres ne sont pas couverts et restent à la charge du stagiaire.

  UMR CARRTEL-INRAE - 75 bis avenue de Corzent - 74200 Thonon-les-Bains

  Inscription jusqu’au 20/03/2026  
Formulaire d'inscription
La sélection sera notifiée en avril.


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Formation - Limnologie générale

16–20 novembre 2026, Thonon-les-Bains (France)

Les inscriptions sont fermées

Liens d'inscription en bas de la page



Vous souhaitez acquérir ou améliorer vos connaissances générales sur les eaux stagnantes françaises ?

Venez participer à la formation intitulée « Limnologie générale ».

Cette formation inscrite au catalogue de formation de l’OFB, est accessible aux agents de l’OFB ainsi qu’aux extérieurs concernés par cette thématique au niveau de leurs missions (p.ex. Parcs, Réserves, Agence de l’eau, agents de services de l’état comme DDT, DREAL, personnel de bureau d’étude, etc.). Elle est développée et dispensée par le Pôle R&D ECLA (OFB-INRAE-USMB).

La formation permettra d’appréhender le fonctionnement des plans d’eau français, de connaitre les principaux composants de la biodiversité, d’identifier les pressions anthropiques et leurs impacts sur le fonctionnement et la biodiversité, d’avoir un aperçu des méthodes de surveillance et de restauration des plans d’eau. La formation combine présentations théoriques et mises en pratique, à travers des études de cas, des échantillonnages de terrain et l’exploration de jeux de données.

La formation est structurée autour de six séquences :
  • Introduction générale sur les plans d’eau :
    Intégration des plans d’eau dans les grands cycles (cycle de l’eau et cycles biogéochimiques), typologie morphologique et biogéographique, services écosystémiques (services de régulation, matériels, non matériels) rendus par des écosystèmes ;
  • Fonctionnement des plans d’eau :
    Aspects physiques (stratification, brassage, etc.) et géochimiques (dioxygène, nutriments, etc.) pouvant structurer la dynamique des plans d’eau, principes d’utilisation in situ de divers instruments (sondes, capteurs, dispositifs de prélèvements du phyto et zooplancton, etc.) pour étudier certains des aspects précédemment vus ;
  • Communautés biologiques et réseaux trophiques des plans d’eau :
    Compartiments benthiques, littoral/peu profond (macrophytes, invertébrés, poissons), pélagiques (phytoplancton, zooplancton, poissons), observations de certaines espèces de phyto et zooplancton en laboratoire ;
  • Pressions anthropiques et stratégies pour les réduire, prévenir :
    Impacts du changement climatique sur le fonctionnement physico-chimique et la biodiversité, familles de stresseurs organiques et inorganiques pouvant agir sur la biodiversité, ainsi que leurs sources et effets écologiques, gestion anthropique des niveaux d’eau et autres forçages (navigation, surfréquentation, espèces exotiques envahissantes) ;
  • Surveillance des plans d’eau :
    Réglementation Directive Cadre Eau (DCE), indicateurs biologiques, hydromorphologique et physico-chimiques utilisés pour l’évaluation de l’état écologique des plans d’eau, méthodes innovantes de surveillance (ADNe, télédétection, hydroacoustique), aperçu de l’accès et de la visualisation de données bancarisées ;
  • Restauration écologique des plans d’eau :
    Définition du concept de restauration écologique, typologie des actions pouvant être mises en place, réflexion sur des cas concrets.

Les cours seront assurés par les agents appartenant au Pôle R&D ECLA et dispensés en français.

Port de la station UMR CARRTEL
Démonstration de prélèvements sur le lac-Crédits photos: A. TESSIER © A. TESSIER
Cas d'étude en groupe-Crédits photos: A. TESSIER © A. TESSIER
Séance de cours-Crédits photos: A. TESSIER © A. TESSIER


Informations utiles :

  Agents OFB et personnes extérieures OFB
(p.ex. Parcs, Réserves, Agence de l’eau, personnel de bureau d’étude, agents de services de l’état comme DDT, DERAL, etc.).
Nombre de places : 15

  5 jours
(du lundi 16 novembre à 13h30 au vendredi 20 novembre à 13h)

  Hôtel Arc en Ciel
18 Place de Crète, Thonon-les-Bains

  L’hébergement est compris dans le coût de la formation, tout comme les frais de repas du mardi au jeudi midi et ceux du soir, du lundi au jeudi.

  UMR CARRTEL-INRAE - 75 bis avenue de Corzent - 74200 Thonon-les-Bains

  Inscription jusqu’au 02/06/2026   Inscription agent OFB

Inscription personne extérieure
La sélection sera notifiée courant de l'été



Formation – Perfectionnement à l’identification des euglénophycées

6–8 janvier 2027, Bordeaux (France)

Les inscriptions sont ouvertes

Informations d'inscription en bas de la page



Vous souhaitez acquérir ou vous améliorez en identification des Euglénophytes ?

Venez participer à la formation intitulée « Perfectionnement à l’identification des euglénophycées ».

Cette formation inscrite au catalogue de formations courtes de l’Université de Bordeaux, est accessible aux techniciens, chercheurs en hydrobiologie, phycologie ou écologie aquatique.

La formation permettra d’identifier les critères morphologiques des Euglénophytes et les principaux genres et espèces de ce groupe. La formation combine cours théoriques, mises en pratique et discussion entre participants.

La formation est structurée autour de 3 jours :
  • Jour 1 – Fondamentaux sur les euglénophycées :
    Introduction, informations générales sur la biologie, l’évolution et références bibliographiques des euglénophycées, Eutreptiales et Phacaceae, préparation des échantillons apportés par les participants ;
  • Jour 2 – Identification des taxons d’euglénophycées :
    Euglenoaceae, détermination des taxons, Euglenoids heterotrophic, détermination des taxons, écologie des Euglenophyceae, détermination des taxons ;
  • Jour 3 – Identification des taxons d’Euglenophytes :
    Détermination des taxons, examen, débriefing.

Les cours seront assurés par divers intervenants dont des agents appartenant au Pôle R&D ECLA et dispensés en anglais.

Vous trouverez les informations complémentaires à la formation ci-dessous.

Informations complémentaires

Logo Université de Bordeaux
Séance de détermination-Crédits photos: F. RIMET © A. TESSIER


Informations utiles :

  Techniciens et chercheurs
(hyrdobiologie, phycologie, écologie aquatique)
Nombre de places : 15

  3 jours
(du mercredi 6 janvier à 14h00 au vendredi 8 janvier à 13h00)

  A la charge du participant

  Pour des renseignements complémentaires contacter : formationscourtes.st@u-bordeaux.fr

  Université de Bordeaux – 351 cours de la Libération - 33400 Talence

  Inscription jusqu’au 30/11/2026   Formulaire inscription
Envoyer le formulaire d’inscription à : formationscourtes.st@u-bordeaux.fr



Formation – Cyanobactérie : identification, méthodes d’observation et comptage

12–15 janvier 2027, Bordeaux (France)

Les inscriptions sont ouvertes

Informations d'inscription en bas de la page



Vous souhaitez savoir identifier les cyanobactérie, maîtriser les techniques d’observation et de comptage ?

Venez participer à la formation intitulée « Cyanobactérie : identification, méthodes d’observation et comptage ».

Cette formation inscrite au catalogue de formations courtes de l’Université de Bordeaux, est accessible aux techniciens, techniciens supérieurs.

La formation permettra d’identifier les cyanobactéries planctoniques et benthiques d’eau douce, maîtriser des techniques de comptages, effectuer le suivi et le comptages avec le logiciel Phytobs, ainsi qu’appliquer les bonnes pratiques de préparation et d’analyses des échantillons.

La formation est structurée autour de 4 jours :
  • Jour 1 – Présentation sur les cyanobactéries d’eau douce :
    Introduction aux cyanobactéries d’eau douce, généralités et critères de détermination, conditionnement des échantillons et méthode de sédimentation ;
  • Jour 2 – Cyanobactéries planctoniques :
    Détermination de cyanobactéries planctoniques, études de cas sur échantillons, pratique de clés dichotomiques ;
  • Jour 3 – Cyanobactéries benthiques :
    Détermination de cyanobactéries benthiques, études de cas sur échantillons ;
  • Jour 4 – Comptage :
    Stratégie de comptage, utilisation du logiciel Phytobs.

Les cours seront assurés par divers intervenants dont des agents appartenant au Pôle R&D ECLA.

Vous trouverez les informations complémentaires à la formation ci-dessous.

Informations complémentaires



Informations utiles :

  Techniciens, techniciens supérieurs
(Unité de traitement d’eau potable, laboratoire, bureaux d’études)
Nombre de places : 15

  4 jours
(du mardi 12 janvier à 14h00 au vendredi 15 janvier à 13h00)

  A la charge du participant

  Pour des renseignements complémentaires contacter : formationscourtes.st@u-bordeaux.fr

  Université de Bordeaux – 351 cours de la Libération - 33400 Talence

  Inscription jusqu’au 11/12/2026  
Demande d’inscription à faire auprès de : formationscourtes.st@u-bordeaux.fr



Formation – Initiation phytoplancton et mise en oeuvre de l’IPLAC

31 mai–4 juin 2027, Bordeaux (France)

Les inscriptions sont ouvertes

Informations d'inscription en bas de la page



Vous souhaitez savoir identifier les principaux taxons du phytoplancton, appliquer les méthodes d’observation microscopique et de comptage, calculer l’indice phytoplancton lacustre (IPLAC) ?

Venez participer à la formation intitulée « Initiation phytoplancton et mise en œuvre de l’IPLAC ».

Cette formation inscrite au catalogue de formations courtes de l’Université de Bordeaux, est accessible aux techniciens, ingénieurs et biologistes.

La formation permettra de déterminer les principaux groupes du phytoplancton (cyanobactéries, algues vertes et chrysophycées), préparer, manipuler et observer des échantillons, utiliser des clés de détermination, mettre en œuvre un méthode de comptage (méthode Utermöhl), exploiter et interpréter les résultats de comptage et calculer l’IPLAC. La formation combine cours théoriques, séances pratiques et discussion entre participants.

La formation est structurée autour de 5 jours :
  • Jour 1 – Généralité et méthode de comptage :
    Présentation phytoplancton et acquisition de données, méthode Utermöhl, préparation d’échantillons planctoniques apportés par les participants ;
  • Jour 2 – Détermination de cyanobactéries, euglenophycées et indice IPLAC :
    Présentation des cyanobactéries, critères de détermination, études de cas sur échantillons, détermination des taxons, indice IPLAC ;
  • Jour 3 – Détermination de cryptophycées, xanthophycées, chrysophycées, diatomés et dinophycées :
    Présentation et déterminations des taxons ;
  • Jour 4 – Détermination de chlorophycées (dont desmidées), présentation de Phytobs :
    Présentation et déterminations des taxons ;
  • Jour 5 – Utilisation Phytobs et évaluation :
    Calcul IPLAC, utilsation Phtyobs en comptage, test d’évaluation, debriefing.

Les cours seront assurés par divers intervenants dont des agents appartenant au Pôle R&D ECLA.

Vous trouverez les informations complémentaires à la formation ci-dessous.

Informations complémentaires



Informations utiles :

  Techniciens, ingénieurs et biologistes
(Laboratoires, Agences de l’eau, collectivités, bureaux d’études)
Nombre de places : 15

  5 jours
(du lundi 31 mai à 14h00 au vendredi 4 juin à 12h30)

  A la charge du participant

  Pour des renseignements complémentaires contacter : formationscourtes.st@u-bordeaux.fr

  Université de Bordeaux – 351 cours de la Libération - 33400 Talence

  Inscription jusqu’au 30/04/2027  
Demande d’inscription à faire auprès de : formationscourtes.st@u-bordeaux.fr